Entstanden 1994 auf Initiative einiger Eltern, die in Magdeburg neue pädagogische Wege gehen wollten, hat sich der Verein inzwischen etabliert.
Ohne einen starken Partner oder Geldgeber im Rücken ist es allein dem Engagement und dem Enthusiasmus dieser Eltern zu verdanken, dass die Freie Schule Magdeburg 1997 ihre Arbeit aufnehmen konnte. Dafür haben die Vereinsmitglieder auch finanziell einiges in Kauf genommen. Um die Schule in den ersten drei Jahren unterhalten zu können, musste ein Darlehen in Höhe von fast 200.000 Mark aufgenommen werden.
Nach dreijährigem Betrieb wurde die Freie Schule anerkannt und erhielt staatliche Zuschüsse. Inzwischen ist das Darlehen vollständig getilgt.
Was mit nur sieben Gründungsmitgliedern begann, hat sich bis heute zu einem recht großen Verein entwickelt. Fast 200 Eltern, Pädagog/innen und andere Interessierte unterstützen aktuell die Vereinsziele.
Bereits vor Eröffnung der Freien Schule begann der Verein im Jahr 1996 die Montessori-Weiterbildung (Diplom-Kurs) für Pädagog/innen und andere Interessierte zu organisieren.
Im Jahr 2000 kam die Trägerschaft für den Hort der Freien Schule hinzu.
Mit der Eröffnung des Montessori-Kinderhauses Anfang 2003 wurden die Voraussetzungen geschaffen, das pädagogische Konzept auf den frühkindlichen Bereich zu erweitern.